In de winter van 1945 beviel de olifant Sakura van een babyolifant in de Tokyo Fujimi Zoo onder het toeziend oog van de dierenverzorger Shota Tanabe. Rond dezelfde tijd beviel Shota's vrouw, Setsuko, ook van een zoon. Hanako, de babyolifant, groeit op en verdiept haar band met basisschoolleerlingen die van dierentuinen houden. Maar nu Japan betrokken raakt bij de oorlog in de Stille Oceaan, geeft het leger opdracht de dieren in de dierentuinen van vijf grote steden te doden.