Después de los compromisos de invitados en Friburgo y Essen, Manuela Uhl tuvo de 1995 a 2000 un compromiso permanente en el Badische Staatstheater Karlsruhe, donde cantó Pamina, Reina de la noche, los papeles principales en Daphne (Strauss), Margarethe (Charles Gounod), Armida ( Haydn) y Anne Frank (Frid), entre otros roles. En 2000 se mudó al conjunto de Bühnen Kiel, al que perteneció hasta 2003. Allí, amplió su repertorio con otros dos papeles principales de Strauss (Danae y Aminta), así como varios otros grandes papeles de la última época romántica. Manuela Uhl ha actuado repetidamente en el Hamburgischen Staatsoper, el Staatsoper Stuttgart, el Deutschen Oper Berlin y el Staatsoper Berlin, en Köln, Essen, Braunschweig, Münster, Innsbruck y Wiesbaden y realizó papeles principales en los festivales Handel en Karlsruhe y Halle. En la temporada 2005-2006, cantó Elisabetta, Desdemona y Rusalka, apareció como invitada en varias ocasiones e hizo su debut como Violetta en L.v. Leonor de Beethoven en Tokio. Ella atrajo la atención internacional con su Salomé en la Ópera de Montpellier, dirigida por Friedemann Layer. Desde la temporada 2006-2007 se la puede escuchar en el conjunto de la Deutschen Oper Berlin. Allí cantó en tres producciones, el papel principal femenino en Germania de Franchetti en Traumgörge de Zemlinsky y en Freischütz (Agathe). El 10 de mayo de 2008, Manuela Uhl cantó arias de conciertos de Mozart con el Rundfunk-Sinfonieorchester Berlin bajo la batuta de Marek Janowski.